// Le JS dans la div ci-dessous a été inséré par une requete AJAX
// <div id='mydiv'> <script type='text/javascript'> [...] </script> </div>

var div = document.getElementById('mydiv');
div.innerHTML = innerHTML;
var x = div.getElementsByTagName("script"); 
for(var i=0;i<x.length;i++)
{
       eval(x[i].text);
}